FISA lleva a cabo auditorias a proveedores basados en el Análisis de Riesgo en los Puntos Críticos de Control (HACCP por sus siglas en inglés), Buenas Prácticas de Manufactura, Procedimientos Estándar de Operaciones de Saneamiento (SSOP por sus siglas en inglés), Procedimientos Estándar de Operación (SOP por sus siglas en inglés) y revisiones de producto recuperado del mercado además de factores físicos, químicos y biológicos. Las auditorias a los proveedores se elaboran de acuerdo a sus requisitos de acverdoa su situación.